Search results for "16s rRNS"
showing 8 items of 8 documents
Fēču mikrobiotas raksturojums un to ietekmējošie faktori bērniem
2020
Ievads. Agrīna mikrobiotas attīstība ietekmē gan imūnsistēmas nobriešanu, gan dažādu patoloģiju, kā, piemēram, alerģijas, infekciju un citu slimību attīstību bērnībā, tāpēc nepieciešams identificēt mikrobiotas sastāva atšķirības un to ietekmējošos agrīnos riska faktorus bērniem. Darba mērķis. Pētīt fēču mikrobiotas sastāvu pirmsskolas vecuma bērniem un analizēt to ietekmējošos faktorus. Materiāli un metodes. Šķērsgriezuma pētījums veikts primārajos veselības aprūpes centros. Bērnu (līdz piecu gadu vecumam) vecākiem tika lūgts aizpildīt anketu (demogrāfiskie dati, dzimšanas veids, barošana pirmajā dzīves gadā, antibakteriāla terapija mātei laktācijas laikā, ģimenes dati) un atnest bērna fēču…
Amoksicilīna un klaritromicīna kombinētās terapijas ilgtermiņa ietekme uz zarnu trakta mikrobiomu
2018
Helicobacter pylori ir viens no pirmajiem identificētajiem bakteriālajiem karcinogēniem un Eiropas medicīnas pārstāvju izstrādātās vadlīnijas iekļauj eradikācijas shēmu, kurā ietilpst kombinēta plaša spektra antibiotiku pielietošana. Antibakteriālā terapija, it īpaši plaša spektra antibiotiku pielietošana rada risku īstermiņa un ilgtermiņa zarnu trakta mikrobioma disbiozes attīstībai. Maģistra darba mērķis bija noskaidrot Helicobacter pylori kombinētās antibakteriālās terapijas izraisītās ilgtermiņa izmaiņas zarnu trakta mikrobiomā. Pētījuma gaitā tika veikta 45 pacientu 16s rRNS amplikonu analīze, salīdzinot pirms un pēc terapijas iegūtos fēču paraugus. Ilgtermiņa antibakteriālās terapijas…
16S rRNS gēna vairāku un divu mainīgo reģionu mikrobioma rekonstrukcijas algoritmu iegūto rezultātu salīdzināšana
2022
16S rRNS marķiergēna sekvencēšana ir viena no plašāk izmantotākajām un lētākajām mikrobioma taksonomiskā profila rekonstruēšanas metodēm. Taču, īso sekvencēšanas nolasījumu dēļ, visi gēna mainīgie reģioni nevar tikt nolasīti vienlaicīgi, bet tos nolasot atsevišķi zūd katra atsevišķā reģiona sasaiste ar pārējiem molekulas reģioniem kā arī par katru var tikt iegūts atšķirīgs datu apjoms, kas ierobežo kopējo mikrobioma kopas profilēšanas izšķirtspēju. Šajā darbā tiek aplūkota varbūtiskās rekonstrukcijas algoritma pieeja, kura izmanto vairāku 16S rRNS gēna reģionu noleases datus un maksimālās iespējamības varbūtisko algoritmu mikrobioma taksonomiskā profila rekonstrukcijai. Izmantojot Short MUl…
Fēču mikrobiotas īpatnības bērniem ar alerģiju
2021
Ievads.Zarnu mikrobiota ir daudzpusīgs un dinamisks process, kas sastāv no mikroorganismu sugu kopuma. Kuņģa-zarnu trakta mikrobiota ir viena no lielākajām un tā spēj darboties caur vairākām organismu asīm. Pašreizējie dati liecina, ka bērna agrīnai zarnu trakta mikrobiotai ir cieša saikne ar imūno sistēmu un alerģisko slimību attīstības risku. Noteicošais faktors bērna tālākai mikrobioma kolonizācijai ir pirmais dzīves gads, kad sākas intensīvākā mikroorganismu kolonizācija zarnās. Darba mērķis. Izpētīt fēču mikrobiotu bērniem ar un bez alerģijas, kā arī analizēt mikrobiotu ietekmējošus faktorus. Materiāli un metodes. Šķērsgriezuma pētījums tika veikts primārajos veselības aprūpes centros.…
Cilvēka asins mikrobioma kompozīcijas, stabilitātes un izcelsmes noteikšana veselos indivīdos
2021
Neseni pētījumi ir apliecinājuši asins mikrobioma klātesamību veselos cilvēkos, tomēr tā izcelsme vēl ir neskaidra. Maģistra darba mērķis bija noskaidrot asins mikrobioma kompozīciju, potenciālo izcelsmi un dinamiku laika gaitā veseliem indivīdiem. Asins mikrobioma izcelsmes noskaidrošanai 10 veseliem indivīdiem ievāca pilnasins paraugus un ādas, maksts, mutes un fēču mikrobioma uztriepes. Pilnasins un fēču paraugus ievāca no diviem laika punktiem ar 3 mēnešu intervālu. Ar 16S rRNS gēna V3-V4 reģiona analīzi noteica to taksonomisko sastāvu. Noskaidrojās, ka asins mikrobioms ir unikāls - tajā izteikti dominē Proteobacteria tipa Pseudomonas ģints pārstāvji, un vienlaikus tā potenciālā izcelsm…
Ar metformīna lietošanu asociētas izmaiņas cilvēka zarnu mikrobioma sastāvā un DNS metilēšanas profilos
2017
Metformīns ir pirmās izvēles medikaments 2. tipa cukura diabēta ārstēšanā. Tam raksturīga variabilitāte terapijas efektivitātē un biežas blaknes. Medikamenta iedarbību var ietekmēt tādi faktori kā mijiedarbība ar zarnu mikrobiomu un gēnu ekspresijas regulācija DNS metilēšanas līmenī. Maģistra darba mērķis bija noskaidrot, kādas izmaiņas metformīns ierosina cilvēka zarnu mikrobioma kompozīcijā un leikocītu metilēšanas profilā. Darbā tika veikta 16S rRNS amplikonu analīze 18 metformīna lietotāju fēču paraugos un DNS metilēšanas novērtēšana 12 indivīdiem. Metformīna ierosinātas izmaiņas gan zarnu mikrobiomā, gan metilēšanas profilā tika novērotas jau pirmo 24 stundu laikā, daļēji skaidrojot ie…
Taksonomiskās izmaiņas zarnu mikrobioma sastāvā, lietojot metformīnu, pacientiem ar 2.tipa cukura diabētu
2018
Metformīns ir medikaments, kurš tiek plaši izmantots 2.tipa cukura diabēta (T2D) ārstēšanā un kura lietošanas laikā būtiski izmainās cilvēka zarnu mikrobioma baktēriju daudzveidība. Bakalaura darba mērķis bija raksturot ar metformīna īstermiņa terapiju asociētās taksonomiskās kompozīcijas izmaiņas zarnu mikrobiomā jaundiagnosticētiem T2D pacientiem. No 23 iesaistīto T2D pacientu fēču paraugiem tikai izdalīta mikrobiālā DNS, veikta mazās ribosomālās subvienības gēna (16S rRNS) V3 reģiona taksonomiskās kompozīcijas analīze ar lielapjoma paralēlo sekvenēšanu. Rezultātā novērota statistiski būtiskas atšķirības β-daudzveidībā un fenotipa specifiskas izmaiņu tendences baktēriju iekšējā daudzveidī…
Antidiabētiskā medikamenta metformīna lietošanas ietekme uz cilvēka zarnu mikrobiomu
2015
Metformīns ir plaši lietots medikaments 2. tipa cukura diabēta ārstēšanā. Pastāv hipotēze, ka metformīna ietekme uz organismu daļēji varētu tikt skaidrota ar tā mijiedarbību ar zarnu mikrobiomu. Bakalaura darba mērķis bija noskaidrot, kā metformīns ietekmē zarnu mikrobioma kompozīciju. Darba ietvaros tika izdalīta mikrobiālā DNS no astoņu cilvēku fēču paraugiem, kas bija ievākti dažādos laika posmos no metformīna lietošanas uzsākšanas, un, izmantojot lielapjoma paralēlo sekvenēšanu, veikta 16S rRNS V3 reģiona analīze, lai salīdzinātu mikrobioma kompozīciju. Pēc nedēļu ilgas metformīna lietošanas tika novērotas būtiskas izmaiņas vairāku taksonomisko vienību īpatsvarā un mikrobioma iekšējās d…